Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms