Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms