Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms