Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms