Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMPD1Q5SYB0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms