Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP170Q5SW79 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms