Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms