Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC23Q53EV4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms