Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms