Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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