Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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