Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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