Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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