Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms