Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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