Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms