Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM28Q13263 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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