Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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