Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BNIP1Q12981 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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