Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTP4A2Q12974 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTP4A2Q12974 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTP4A2Q12974 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTP4A2Q12974 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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