Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC10A2Q12908 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms