Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms