Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms