Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms