Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms