Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms