Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms