Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms