Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIA4P48058 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms