Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms