Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms