Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TGFBR1P36897 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGFBR1P36897 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGFBR1P36897 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms