Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms