Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACGP22612 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKACGP22612 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms