Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGCP20142 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGCP20142 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms