Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms