Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA4P06727 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA4P06727 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA4P06727 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA4P06727 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA4P06727 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA4P06727 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms