Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1O95273 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1O95273 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms