Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL2O95198 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL2O95198 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms