Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL18O94889 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms