Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PDE6DO43924 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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