Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRODHO43272 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms