Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HCG22E2RYF7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HCG22E2RYF7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms