Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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