Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TRBV2A0A0J9YWF9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TRBV2A0A0J9YWF9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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