Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms