Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBNO2Q9Y2G9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SBNO2Q9Y2G9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms