Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX6Q9UNH7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms