Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms