Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms